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盛合瑞生物
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01模型库建立的标准化流程

模型库中的类器官要达到可应用的标准,除了要保证类器官的种类和数量,更需要严格的质量控制标准。类器官建库是一项持久、精细、高难度的产出过程,我们始终秉持高标准、严要求的原则,为用户提供高质量的类器官样本。

模型库建立流程
一级库→二级库

一级库样本转为二级库样本前需要进行信息复核(样本来源信息、类器官ID信息)及检测质控(支原体检测、复苏验证)。我们对所有入库类器官均进行支原体检测,以确保库中的类器官不存在支原体污染,从而保持类器官库的高质量。

二级库→应用

二级库样本在进行应用前将再次进行信息复核(样本来源信息、类器官ID信息)及检测质控(支原体复测、复苏验证、类器官鉴定)。类器官鉴定包括形态学鉴定(HE染色、免疫组化/荧光染色)、基因组鉴定(全基因组或外显子组测序)、STR鉴定,以保证类器官对来源组织的代表性,为后续研究的真实性及可靠性奠定了基础。

02类器官模型库鉴定内容

类器官形态学鉴定

类器官的形态学鉴定使用HE染色、免疫组化染色、免疫荧光染色等方法,以明确类器官与来源组织在形态、特征性生物标志物的表达方面具有一致性。

HE染色

来源组织与类器官的HE染色:A. 人前列腺癌肿瘤组织HE染色。B. 人前列腺癌类器官HE染色。C. P0代人前列腺癌类器官明场图。D. P1代人前列腺癌类器官明场图。比例尺:100 μm。

免疫组化染色

来源组织与类器官的免疫组化染色:A. 人胃癌肿瘤组织免疫组化染色(CK7)。B. 人胃癌类器官免疫组化染色(CK7)。C. 人胃癌肿瘤组织免疫组化染色(Ki67)。D. 人胃癌类器官免疫组化染色(Ki67)。比例尺:100 μm。

免疫荧光染色

类器官的免疫荧光染色:A. 小鼠小肠类器官免疫荧光染色结果显示肠绒毛标志物(Villin,绿色)、杯状细胞标志物(Muc2,红色)以及细胞核标志物(DAPI,蓝色)。B. 小鼠小肠类器官免疫荧光染色结果显示肠绒毛标志物(Villin,绿色)、肠上皮细胞标志物(E-cad,红色)以及细胞核标志物(DAPI,蓝色)。C. 小鼠小肠类器官免疫荧光整体染色结果显示Villin(绿色)、Muc2(红色)及DAPI(蓝色)。比例尺:100 μm。

类器官基因组鉴定

类器官的基因组鉴定使用全基因组或全外显子组测序等方法,以明确类器官与来源组织在基因表达、变异等方面具有一致性。如将胃癌类器官及其对应的胃癌组织进行全外显子组测序,分析和比较体细胞单核苷酸变异(SNV)情况。突变景观图详细展示了前30个常见的胃癌SNV基因情况,突变最普遍的基因为CSDM和TTN。堆叠柱状图显示,胃癌组织和类器官之间SNV一致性均超过80%,表明胃癌类器官模型很好地还原了胃癌组织的基因突变谱。

基因组鉴定

来源组织与类器官的基因组鉴定:A. 胃癌组织和对应类器官样本前30个常见SNV基因突变景观图(n = 8)。X轴上方Panel统计的是各个样本中所有被检测到的肿瘤突变负荷数以及各类型突变在各个样本中的占比。Y轴右侧Panel统计的是前30个常见基因分别在所有样本中突变类型的占比。B. 胃癌组织和对应的胃癌类器官样本SNV一致性统计图(n = 8)。

类器官STR鉴定

短串联重复序列(STR)多态性已成为法医学中个人识别和亲子鉴定的丰富来源。STR基因分型方法是进行细胞交叉污染和性质鉴定的最有效和准确的方法之一,被ICLAC、ATCC等权威机构作为金标准应用于细胞鉴定。对类器官及其来源组织的STR进行比对,可鉴定两者的一致性。

STR鉴定

来源组织与类器官的STR鉴定:人结肠癌肿瘤组织与其来源的结肠癌类器官STR鉴定部分结果。

类器官建库报告案例
建库报告案例

类器官建库报告展示:A. 人食管鳞癌建库分析报告。B. 人小肠类器官建库分析报告。

03类器官模型

将类器官作为模型的研究逐年增加。近年来,类器官模型已成为研究包括肿瘤及非肿瘤疾病在内的多种疾病的主流手段。

类器官模型研究趋势
非肿瘤疾病类器官模型

值得注意的是,类器官在非肿瘤疾病领域的应用更多,涉及消化道、呼吸道、心血管等多种系统的疾病。此外,类器官在神经退行性疾病、自身免疫性疾病等领域也有较多应用。

非肿瘤疾病类器官模型

04可提供的类器官模型

我们的类器官模型库中有上千例不同种类的类器官模型,包含肿瘤组织来源的类器官模型及正常组织/iPSC来源的类器官模型,其来源的临床信息、分子及遗传信息、患者数据等十分完整,可直接用于开展科学研究、药物开发等应用。

类器官模型类型
正常组织/iPSC类器官
正常组织类器官
肿瘤组织来源类器官
肿瘤组织类器官